MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Sat464 chromosome

Total Repeats: 28930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017359	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	384893617
2	NC_017359	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	384893617
3	NC_017359	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893617
4	NC_017359	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	384893617
5	NC_017359	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384893617
6	NC_017359	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	384893617
7	NC_017359	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	384893617
8	NC_017359	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893617
9	NC_017359	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893617
10	NC_017359	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384893617
11	NC_017359	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	384893617
12	NC_017359	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893618
13	NC_017359	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	384893618
14	NC_017359	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893618
15	NC_017359	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893618
16	NC_017359	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	384893618
17	NC_017359	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893618
18	NC_017359	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	384893618
19	NC_017359	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893618
20	NC_017359	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384893618
21	NC_017359	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	384893619
22	NC_017359	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893619
23	NC_017359	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893619
24	NC_017359	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384893619
25	NC_017359	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384893619
26	NC_017359	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384893619
27	NC_017359	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	384893619
28	NC_017359	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	384893619
29	NC_017359	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	384893619
30	NC_017359	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	384893619
31	NC_017359	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384893619
32	NC_017359	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	384893619
33	NC_017359	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	384893619
34	NC_017359	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	384893619
35	NC_017359	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893619
36	NC_017359	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893619
37	NC_017359	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893620
38	NC_017359	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	384893620
39	NC_017359	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384893620
40	NC_017359	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	384893620
41	NC_017359	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893620
42	NC_017359	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	384893620
43	NC_017359	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	384893620
44	NC_017359	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384893620
45	NC_017359	GGT	2	6	1971	1976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893620
46	NC_017359	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893620
47	NC_017359	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893620
48	NC_017359	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893620
49	NC_017359	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	384893620
50	NC_017359	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893620
51	NC_017359	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893620
52	NC_017359	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384893620
53	NC_017359	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	384893620
54	NC_017359	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	384893620
55	NC_017359	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	384893621
56	NC_017359	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	384893621
57	NC_017359	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	384893621
58	NC_017359	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	384893621
59	NC_017359	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384893621
60	NC_017359	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	384893621
61	NC_017359	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	384893621
62	NC_017359	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	384893621
63	NC_017359	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893621
64	NC_017359	T	6	6	3020	3025	0 %	100 %	0 %	0 %	384893621
65	NC_017359	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893621
66	NC_017359	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893621
67	NC_017359	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384893621
68	NC_017359	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384893622
69	NC_017359	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	384893622
70	NC_017359	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	384893622
71	NC_017359	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	384893622
72	NC_017359	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	384893622
73	NC_017359	AT	3	6	3480	3485	50 %	50 %	0 %	0 %	384893622
74	NC_017359	AGC	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384893622
75	NC_017359	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384893622
76	NC_017359	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893622
77	NC_017359	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893622
78	NC_017359	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	384893622
79	NC_017359	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	384893622
80	NC_017359	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893622
81	NC_017359	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384893622
82	NC_017359	TGT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384893623
83	NC_017359	GTT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384893624
84	NC_017359	A	6	6	5212	5217	100 %	0 %	0 %	0 %	384893624
85	NC_017359	AAT	2	6	5238	5243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893624
86	NC_017359	TAAAA	2	10	5247	5256	80 %	20 %	0 %	0 %	384893624
87	NC_017359	ATAAA	2	10	5266	5275	80 %	20 %	0 %	0 %	384893624
88	NC_017359	T	6	6	5277	5282	0 %	100 %	0 %	0 %	384893624
89	NC_017359	CAT	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893625
90	NC_017359	GCC	2	6	5445	5450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384893625
91	NC_017359	TCT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893625
92	NC_017359	GAAACC	2	12	5554	5565	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384893625
93	NC_017359	AAT	2	6	5604	5609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893625
94	NC_017359	CTT	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893625
95	NC_017359	TTCA	2	8	5682	5689	25 %	50 %	0 %	25 %	384893625
96	NC_017359	CAT	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893625
97	NC_017359	GC	3	6	5749	5754	0 %	0 %	50 %	50 %	384893625
98	NC_017359	ATG	2	6	5755	5760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893625
99	NC_017359	TCA	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893625
100	NC_017359	CCG	2	6	5833	5838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384893625
101	NC_017359	CTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893625
102	NC_017359	TCA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893625
103	NC_017359	T	6	6	5901	5906	0 %	100 %	0 %	0 %	384893625
104	NC_017359	AG	3	6	5961	5966	50 %	0 %	50 %	0 %	384893625
105	NC_017359	TCTT	2	8	5976	5983	0 %	75 %	0 %	25 %	384893625
106	NC_017359	CAT	2	6	6056	6061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893625
107	NC_017359	GTG	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893625
108	NC_017359	TTC	2	6	6168	6173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893625
109	NC_017359	TGA	2	6	6176	6181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893625
110	NC_017359	CCG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384893625
111	NC_017359	TTTCT	2	10	6218	6227	0 %	80 %	0 %	20 %	384893625
112	NC_017359	CAC	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384893625
113	NC_017359	T	6	6	6362	6367	0 %	100 %	0 %	0 %	384893625
114	NC_017359	TAG	2	6	6369	6374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893625
115	NC_017359	T	7	7	6401	6407	0 %	100 %	0 %	0 %	384893625
116	NC_017359	CTT	2	6	6542	6547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893625
117	NC_017359	TCT	2	6	6652	6657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893625
118	NC_017359	T	6	6	6669	6674	0 %	100 %	0 %	0 %	384893625
119	NC_017359	T	6	6	6681	6686	0 %	100 %	0 %	0 %	384893625
120	NC_017359	TAA	2	6	6695	6700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893625
121	NC_017359	AAGC	2	8	6791	6798	50 %	0 %	25 %	25 %	384893625
122	NC_017359	GCA	2	6	6826	6831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384893625
123	NC_017359	CTT	2	6	6851	6856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893625
124	NC_017359	T	6	6	6953	6958	0 %	100 %	0 %	0 %	384893625
125	NC_017359	T	6	6	7104	7109	0 %	100 %	0 %	0 %	384893626
126	NC_017359	ACA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893626
127	NC_017359	TCT	2	6	7204	7209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893626
128	NC_017359	CTT	2	6	7286	7291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893626
129	NC_017359	GAT	3	9	7374	7382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893626
130	NC_017359	TCT	2	6	7402	7407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893626
131	NC_017359	CTA	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893626
132	NC_017359	GATA	2	8	7767	7774	50 %	25 %	25 %	0 %	384893627
133	NC_017359	TTG	2	6	7833	7838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384893627
134	NC_017359	GAA	2	6	7849	7854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893627
135	NC_017359	TCAA	2	8	7874	7881	50 %	25 %	0 %	25 %	384893627
136	NC_017359	AGA	2	6	8043	8048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893627
137	NC_017359	ACC	2	6	8051	8056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384893627
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